Министр Правительства Москвы и Руководитель Департамента потребительского рынка и услуг Москвы с 1993 по 2010 годы.

1997-2010 – Заведующий кафедрой экономики и управления предприятиями питания Российского экономического университета им. Г.В. Плеханова. Имеет звание «Почетный доктор наук РЭА им. Г.В. Плеханова».

В 2007 году была создана научная школа профессора В.И. Малышкова.

С 1997 года – президент Московской академии предпринимательства при Правительстве Москвы. Преподавательская деятельность: педагогический стаж – 48 лет, подготовил 10 кандидатов наук, автор свыше 110 печатных изданий (статьи, монографии, справочники, учебные пособия, учебники). В 2005 году под руководством В. И. Малышкова вышел первый в России учебник «Экономика и управление предприятиями питания». Книги: в 1997 году «Потребительский рынок Москвы: вчера, сегодня и ближнее завтра», в 2012 году книга «Два вступления России в капитализм. Очерки о торговле». В Академии сформировалась научно-практическая школа «Развитие предпринимательства на потребительском рынке», руководителем которой является Владимир Иванович Малышков, в рамках научной школы проводится научно-практическая работа Академии.

Владимир Иванович является Председателем Ученого Совета МосАП, главным редактором научного журнала «Вестник Академии».

В области научных исследований: разработана концепция развития в Российской Федерации системы быстрого питания, на основе которой была создана система быстрого питания «Русское бистро»; на основе разработанной им системы создания российских сетевых структур в розничной торговле организованы и развиваются такие сети, как «Перекресток», «Копейка», «Пятерочка» и другие; внедрена инновационная система торговли «Утконос», не имеющая аналога в мире; разработана межрегиональная товаропроводящая система «Московские контракты» для предприятий потребительского рынка города Москвы.

Владимир Иванович награжден медалями: «Ветеран труда», «В память 850-летия Москвы», награжден Орденом Почета, знаком отличия «За безупречную службу городу Москве» ХХ лет, Золотым Почетным знаком имени Николая Румянцева «За достижения», Почетным алмазным орденом «Общественное признание». За личный вклад в подготовку и проведение празднования 50-летия Победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 годов объявлена Благодарность Президента Российской Федерации, за большой личный вклад в социально-экономическое развитие столицы и в связи с 850-летием основания Москвы награжден Почетной грамотой Российской Федерации, знаком Департамента потребительского рынка и услуг города Москвы «За многолетний и добросовестный труд в системе потребительского рынка и услуг города Москвы» 30 лет, а также многочисленными государственными и общественными благодарностями и почетными грамотами.

Православными орденами преподобного Сергия Радонежского, Святого благоверного князя Даниила Московского трех степеней, Святого равноапольстольского великого князя Владимира, Петра Первого Великого, Английским орденом «Королевы Виктории».

В связи с 15-летием Московской Академии предпринимательства при Правительстве Москвы президент Академии д.э.н., профессор Малышков Владимир Иванович награжден Орденом «За вклад в развитие науки», за личный вклад в подготовку квалифицированных специалистов для сферы торговли и услуг города Москвы – Почетной грамотой Департамента торговли и услуг города Москвы, Почетной грамотой городского комитета профсоюза работников торговли, общественного питания и потребительской кооперации города Москвы.